Мне как то всегда казалось, что клоны должны выполнять роль "пилота", для генерации АТ-поля и активации Евы, когда управлением будет заниматься лишенная души электроника. Поэтому, Мая и сказала, что псевдопилот был еще не завершен на момент битвы с Барди. Ну, ответ на этот вопрос мы наверное никогда не узнаем)